Писах нещо за Y хромозомата, но затворих прозореца за жалост. Накратко идеята е, по-голяма част от Y хромозомата натрупва вредни мутации (не можа да се оттърве от тях), защото не може да се рекомбинира (да обменя варианти на гените си с друга хромозома). Изследвания сочат, че през последните 25 млн. г. Y хромозомата е загубила само 1 ген. Основна част от гените върху Y хромозомата отговарят за сперматогенезата, така че мутации, предизвикващи загуба на функциите на тези гени, не могат да се предадат в следващото поколение, защото без сперма няма деца. Най-важният ген върху Y хромозомата е SRY (sex-determining region Y), който инструктира ембриона с Y хромозома да образува тестиси (регионът, който определя мъжкия пол). При нянакъв вид плъхове в Япония Y хромозомата е изчезнала, но не и мъжките представители на вида. Върху друга хромозома се появил нов ген, отговарящ за определянето на пола.